Речь идет о написании защиты для зоны администрирования системы управления контентом веб-сайта.Какие Вы знаете способы построения системы аутентификации главного администратора?
пишешь любую авторизацию для админки от простой формы с пост или гет запросом до бэйсик авторизации или вобще через файл 0о
Хранить логин, пароль. Это очень по-аматорски, если логин и пароль спокойно лежит себе на ftp в отдельном файле. Речь идет просто о серьезных системах, нормальных.