Знаю,что банально,но давай-ка просканируй комп на вирусы (это не помешает во всяком случае): Malwarebytes Anti-Malware - http://www.techspot.com/downloads/4716-malwarebytes-antimalware.html
В общем вот где эта утварь сидит, чисти: http://talkwebber.ru/topic/29259-massovii-vzlom-saitov-dle-vot-i-moja-ochered/page__st__60#entry278698 Зачистили. Как я и предполагал, все дело было в Index.php.