если речь о винде, то можно попробовать кинуть пустой батник с именем shutdown.bat или shutdawn.cmd в %windir% хз правда сработает или нет
Затереть в System32 файл shutdown.exe предварительно забэкапив, ну или сделав свою прослойку допустим которая будет спрашивать пароль.
немного не то, мои коллеги, злые админы заеб..и "шутить" с этой командой. насчет затереть ехе пробовал не получилось, команда посылается из ком . строки