влияет ли антиддос (cloudflare) на индексацию поисковыми системами и в целом на результат ранжирования?
Конкретно на индексацию - однозначно не влияет. А вот потери с трафика в RU сегменте (да и не только) будут хорошими, не забывайте, что айпишники клоуда забанены чуть не у половины населения.