можно ли чем то проверить файлы на изменение и если в них что то было добавлено в исходный код файлов то найти это можно ? а так же проверку на наличие новых файлов на хостинге? попросили один хостинг проверить - там что то внедрили в файлы и хрен отскать, тк файлов море да и по дате найти когда редактировались не вышло, дату и время можно модифицировать...
собрать дерево папок и файлов на момент отсутствия там изменений и проверять (ls -a рекурсивно или tree). конкретно у файлов можно взять md5, как это делать я тебе уже отвечал где-то в твоем треде
Если есть архив с точно "неизмененными" файлами, берем утилитку WinMerge. Она умеет сравнивать каталоги, и определит измененные файлы вплоть до измененых строк. А вот если такого архива нету, то боюсь только ручками анализировать. А на будущее очень удобно для этого юзать какую нибудь систему контроля версий (типа git), дабы не изобретать велосепеды с хеш суммами и прочее.
А вообщем если у них файлов куча, если все решиш, им надо сделать версии. Ну или сделать список всех файлов в мд5 и потом кроном сверять ежедневно - и оповещать если где то что то не так.