Выпущена свободная альтернативная реализация протокола и клиента Skype, сообщает Linux.org.ru. «Известный реверсер Ефим Бушманов за 5 с лишним лет смог разобрать проприетарный зашифрованный протокол и выпустил первый альтернативный клиент Skype. Пока поддерживается лишь платформа Windows (графический интерфейс требует .NET 4) Исходный код на языке C опубликован под лицензией LGPLv3. Доступны и готовые бинарники. Поддерживается обмен текстовыми сообщениями, планируется дальнейшее развитие. Реализованы многие особенности протокола: алгоритмы шифрования, сжатия, инфраструктура публичных ключей.» 4.09.2016 http://news.softodrom.ru/ap/b25922.shtml
пиджин умеет принимать\отправлять зашифрованные сообщения в скайпе (Skype IM protocol support). У обоих должен быть установлен пиджин и плагины шифрования https://developer.pidgin.im/wiki/ThirdPartyPlugins